Στο 63ο Νηπιαγωγείο Θεσσαλονίκης λειτουργούν δύο (2) τμήματα Βασικού Υποχρεωτικού Προγράμματος κι ένα (1) τμήμα Προαιρετικού Ολοήμερου. Παράλληλα λειτουργεί Τμήμα Ένταξης για την υποστήριξη μαθητών/τριών με αναπηρία και ειδικές εκπαιδευτικές ανάγκες.
Βασικό υποχρεωτικό πρόγραμμα (πρώην κλασσικό)
Το Βασικό Υποχρεωτικό Πρόγραμμα (πρώην κλασσικό) είναι το πρόγραμμα που παρακολουθούν όλοι/ες οι μαθητές και οι μαθήτριες του νηπιαγωγείου. Η ώρα προσέλευσης των παιδιών είναι από τις 8.15 π.μ. – 8.30 π.μ. Η αποχώρηση γίνεται στη 13.00 μ.μ.
Προαιρετικό Ολοήμερο Πρόγραμμα (πρώην ολοήμερο)
Όσοι γονείς επιθυμούν μπορούν να εγγράψουν τα παιδιά τους στο Προαιρετικό Ολοήμερο Πρόγραμμα. Τα παιδιά που εγγράφονται σ’ αυτό το πρόγραμμα, αποχωρούν στις 16.00. Στο πλαίσιο του Προαιρετικού Ολοήμερου Προγράμματος υπάρχει η δυνατότητα λειτουργίας πρόωρης υποδοχής, εάν υπάρχουν τουλάχιστον πέντε αιτήσεις γονέων για την ανάγκη δημιουργίας αυτής της ζώνης. Στην περίπτωση αυτή, η ώρα προσέλευσης είναι 7.45 π.μ.- 7.55 π.μ . Η πρόωρη υποδοχή ισχύει μόνο για τα παιδιά που παρακολουθούν το Ολοήμερο Πρόγραμμα.